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홍동완

교수 홍 동 완 Dongwan Hong
교수 정보
교육분야 의료 빅데이터 TEL 02-3147-8424
연구분야 암 멀티오믹스 빅데이터, 인공지능 E-mail dwhong@catholic.ac.kr
소속 의료정보학교실 연구실 이름 honglab.catholic.ac.kr

연구실 소개

연구실 소개
연구실 소개

본 연구실은 암 멀티 오믹스 빅 데이터를 분석하며, 인공지능 기반 생물정보학 연구를 주로 함.


1) 암 돌연변이 시그니처 분석


- 암을 발발하는 돌연변이에 대한 시그니처 특성을 분석하며, 다양한 변이체의 분석 성능을 높이는 분석 도구를 개발함

- 담당 교수는 국제 컨소시움 ICGC ARGO Mutational Signature Working Group 소속으로 최고 수준의 시그니처 분석 방법을 연구함 (https://www.icgc-argo.org/page/87/dcmwg)


2) 암 멀티 오믹스 데이터 분석 및 데이터베이스 구축

- 전암종의 다양한 멀티 오믹스 시퀀싱 데이터 (Long-read/Short-read 전장 유전체, Hi-C 시퀀싱, 전사체 데이터, 단백체)의 통합 분석법을 개발, 연구함

- 이들 데이터의 통합 데이터베이스 시스템을 구축하고 전문화된 분석 도구를 개발함


3) 인공 지능 기반 단백질 3차원 구조 예측


- 알파폴드 등의 인공지능 기반 예측 도구를 활용하여 바이러스 변이, 암 변이 등의 구조 예측 및 평가 방법을 개발함

- 인공 지능 기반 항암 신약 개발 등의 플랫폼 개발


4) 스마트폰 환경에서의 암 멀티 오믹스 데이터 분석

- 전장 유전체 시퀀싱 데이터를 포함한 암 멀티 오믹스 데이터를 모바일 폰 환경에서 분석, 해석, 리포팅하는 프로젝트를 수행함

- 암 유전체 빅 데이터를 NFT로 변환, 공유, 활용하는 연구를 하며, 스마트폰 환경에서 최적의 속도로 암 빅데이터를 활용할 수 있는 플랫폼 연구를 진행함

- 미래의 개인 유전체 시대를 겨냥하여 암 빅데이터의 환경을 모바일로 전향하여 미래형 의료 시스템 개발을 진행함

학력

학력
연도 교육분야 학과 및 전공 학위
1992 한림대학교 전자계산학과 이학사
1996 한림대학교 컴퓨터공학과 공학석사
1998 한림대학교 컴퓨터공학과 공학박사

경력

경력
연도 기관 직위
2001-2003 한림대학교 정보통신공학부 전임강사
2003-2007 송곡대학교 멀티미디어과 조교수
2008-2011 서울대학교 의학연구소 선임연구원
2011-2020 국립암센터 연구소 수석연구원
2020-현재 가톨릭대학교 의과대학 교수

학회활동 / 위촉활동

학회활동 / 위촉활동
기간 학회명 / 기관 직위
2016- 한국유전체학회 홍보위원장/학술위원
2016- 한국생명정보학회 이사
2016- 대한암학회 정보분과위원
2016- 대한생화학학회 정회원
2019- ICGC ARGO 위원

대표논문

대표논문
번호 논문제목 연결
1 OGT and FLAD1 genes had significant prognostic roles in progressive pathogenesis in prostate cancer, The World Journal of Men’s Health, 2022 초록
2 Clonal dynamics in early human embryogenesis inferred from somatic mutation, Nature, 2021 초록
3 FIREVAT: finding reliable variants without artifacts in human cancer samples using etiologically relevant: Genome Medicine, 2020 초록
4 Tracing Oncogene Rearrangements in the Mutational History of Lung Adenocarcinoma, CELL, 2019 초록
5 RhoGAP domain-containing fusions and PPAPDC1A fusions are recurrent and prognostic in diffuse gastric cancer: NATURE COMMUNICATIONS, 9(1):4439~4439, 2018 초록
6 Mutalisk: a web-based somatic MUTation AnaLyIS toolKit for genomic, transcriptional and epigenomic signatures: Nucleic Acids Research, 46(W1):W102~W108, 2018 초록
7 Intron retention is a widespread mechanism of tumor suppressor inactivation: Nature Genetics, 47(11):1242~1248, 2015 초록
8 Genomic profile analysis of diffuse-type gastric cancers: Genome Biology, 15(4):R55, 2014 초록
9 Systematic investigation of cancer-associated somatic point mutations in SNP databases: Nature biotechnology, 31:787~789, 2013 초록
10 FX: an RNA-Seq analysis tool on the cloud: Bioinformatics (IF: 5.468), 28(5):721~723, 2012 초록
11 Extensive genomic and transcriptional diversity identified through massively parallel DNA and RNA sequencing of eighteen Korean individuals, Nature Genetics, 43:745-752, 2011 초록
12 TIARA: a database for accurate analysis of multiple personal genomes based on cross-technology, Nucleic Acids Research, 2011 초록
13 Reference-unbiased copy number variant using CGH microarrays, Nucleic Acids Research, 2011 초록
14 Discovery of common Asian copy number variants using integrated high-resolution array CGH and massively parallel DNA sequencing, Nature Genetics, 42(5):400-405, 2010 초록
15 A highly annotated whole-genome sequence of a Korean individual, Nature, 460:1011-1015, 2009 초록